流式細胞儀分析(Flow cytometry)
服務簡述:以流式細胞儀分析檢體細胞的生理生化特性,或以專一性抗體偵測細胞表面抗原,並進行分群計數、百分比分析。
服務種類
(1) 細胞週期分析:以PI進行染色,檢測藥物對癌細胞是否造成cell cycle arrest。
(2) 細胞凋亡分析:以Annexin-V/PI進行染色,檢測藥物誘導細胞凋亡的情形,可區分早期凋亡以及晚期凋亡。
(3) 特定CD marker之分析:如基礎之NKTB分析、Treg分析等,同時協助抗體與CD marker配色、選用。
(4)上機前處理,包含動物犧牲、組織處理、全血之裂解。
交件時間:
約1~2週。
收樣標準
(1)細胞足量,建議上機時的細胞濃度為5x105~1x106 /ml。
(2)FSC/SSC之圖形應可看出主要細胞群Main。
(3)實驗必須有control組。
檢體種類:
(1)全血。
(2)肺泡沖提液。
(3)細胞。
(4)組織。
(5)其他特殊檢體。
服務流程:
(1)專人討論實驗流程,確認檢測項目、檢體類型、收件方式、前測試以及報價。
(2)先支付材料費或整體案件50%之訂金。
(3)執行上機前之品管。
(4)執行實驗。
(5)出具報告(Raw data為FCS檔、以PDF整理好之結果圖、Excel整理好之統計表)。
(6)支付尾款、結案。
常見QA:
細胞週期部分:可參考之前流式細胞儀cell cycle的介紹文章
1.圖形出現高背景?
Ans:主要原因為RNAse失效。補救辦法:重新添加RNAse,延長其反應時間。
2.未出現典型圖形?
Ans:
(1)檢查圈門位置是否正確。
(2)調整Gain值(電壓),確認螢光訊號落在可偵測範圍內。
(3)確認螢光的參數為linear,而非log。
(4)確認G1與G2/M位置其螢光強度是否接近2倍。
3.出現典型圖形,但各組別G1、G2/M位置有偏移?
Ans:通常是組別間細胞數量不同,分配到染劑的量有落差。
補救方法:
(1)細胞固定之前先進行細胞計數。
(2)若實驗中出現該問題,將訊號較弱的組別重新添加染劑進行反應。
(3)捨棄套用軟體的分析方式,手動定義Histogram的位置。
4.圖形鋸齒狀嚴重?
Ans:減少清洗的步驟。
5.Control組細胞出現cell cycle arrest?
Ans:細胞培養時的問題,培養密度過高、汙染都有可能造成cell cycle arrest。
細胞凋亡部分:可參考本篇文章
1.對照組死亡嚴重?
Ans:細胞培養或處理時造成壓力,應嘗試縮短處理時間。
2.細胞都無死亡的情形?
Ans:須排除實驗條件問題或是染色條件之問題。
(1)務必設計一組確定會讓細胞死亡的positive control,如以H2O2、漂白水處理之細胞,若該組別也無訊號則為染色問題;若該組別有訊號則應調整操作條件。
3.細胞主群因藥物處理而偏移?
Ans:正常現象,凋亡的細胞在FSC/SSC上的位置會往左上角移動,在分析時,圈選主群細胞的位置應將範圍延伸至左上角。
4.訊號位置異常?
Ans:
(1)針對Annexin-V、PI都做單染,進行螢光補償,單染部分應注意,不可用健康的細胞來做單染(會很少訊號過去,造成補償錯誤)
(2)若擔心是染劑因素所造成,可改用7-AAD取代PI,使染劑發散波段互相干擾的情形減少。
免疫細胞染色部分:
1.如何確認訊號有真實表現而非偽陽性?
Ans:多做一組isotype control,與實驗組疊合,判定真實訊號位置。
2.若要同時看多種細胞,但流式細胞儀配備的螢光或濾片不夠多?
Ans:分組染色,一樣本分成2管。A染:CD3、CD4、CD8;B染:CD45、CD3、CD19依此類推。
3.流式細胞儀如何做絕對之細胞計數?
Ans:配合已知數量的beads,進行實驗,以實際收取到的顆數與理論數量進行校正。